145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3413 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3413  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 196 aa  394  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000152623  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0730  transcriptional regulator, TetR family  52.36 
 
 		 200 aa  192  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000193069  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2309  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.160392  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3709  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0332  transcriptional regulator, TetR family  31.2 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0562  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00242532  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0327  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4190  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.74511  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  19.4 
 
 		 251 aa  52  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0527  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0603321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  21.24 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  21.78 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1344  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000662672 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0331  transcriptional regulator, TetR family  20 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  19 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0160  transcriptional regulator  23.24 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  21.65 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5798  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  23.96 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2087  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0227018  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5146  transcriptional regulator PhaD  36.36 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0391  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.799275  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4025  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272144  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66850  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5376  putative transcriptional regulator, TetR family  21.13 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  20.71 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  22.5 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0059  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0273669  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4339  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4284  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000936887 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4479  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 203 aa  45.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 188 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0422  TetR family transcriptional regulator  21.83 
 
 		 248 aa  45.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  21.83 
 
 		 258 aa  45.4  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  22.16 
 
 		 188 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4103  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350269  normal  0.346351 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0267  HTH-type transcriptional regulator, tetR-family  32.73 
 
 		 214 aa  45.4  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3465  TetR family transcriptional regulator  21.13 
 
 		 248 aa  45.4  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.980317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5056  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 204 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 210 aa  44.7  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 210 aa  44.7  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 210 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4167  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 247 aa  44.7  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5006  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162058  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1857  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 239 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  20.62 
 
 		 254 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1410  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 239 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0318904  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  20.62 
 
 		 254 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5600  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 252 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1600  TetR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 213 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1037  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 239 aa  44.3  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397518  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3239  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 241 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1661  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 252 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3937  transcriptional regulator, TetR family protein  30.91 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.353211  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2311  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 251 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2273  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 252 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0099  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0469573  hitchhiker  0.000212753 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2030  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 238 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0233695  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  20.62 
 
 		 254 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1105  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 253 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0825  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  43.9  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  20.62 
 
 		 254 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0761  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 239 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1265  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 239 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  20.62 
 
 		 254 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1272  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 239 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  20.62 
 
 		 254 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  20.62 
 
 		 254 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0388  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 239 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4880  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1005  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 244 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2189  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 251 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.533648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  22.68 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1320  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 241 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767739  normal  0.281979 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0458  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2296  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 252 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1581  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 223 aa  43.9  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.223478 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  22.34 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4675  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0658  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2387  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 232 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2712  TetR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3899  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3991  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4589  TetR family transcriptional regulator  20.62 
 
 		 248 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.954889 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  21.89 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0807  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1771  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3900  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.113348  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0108  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>