More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0331 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0331  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 209 aa  426  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3522  TetR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 204 aa  210  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9297  putative transcriptional regulator, TetR family  54.01 
 
 		 198 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 206 aa  121  8e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2551  regulatory protein TetR  35.6 
 
 		 190 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140375  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3459  putative transcriptional regulator  35.45 
 
 		 193 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40790  putative transcriptional regulator  35.45 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2712  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1600  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1771  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0807  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2387  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0658  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1100  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1176  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2310  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.145827  normal  0.0377448 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3536  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5376  putative transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1702  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1158  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91676  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  22.68 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1000  regulatory protein, TetR  31.58 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  22.28 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  22.28 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4844  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  24.77 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1626  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432632 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02513  transcriptional regulator, TetR family protein  27.59 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1835  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.214675  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  24.37 
 
 		 189 aa  52.8  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4816  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 244 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0244477 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 222 aa  52.4  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3322  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 201 aa  51.6  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2739  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 225 aa  51.6  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000589766  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1774  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 193 aa  51.6  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 192 aa  51.6  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 193 aa  51.6  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0683  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000557469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  25.49 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00350  transcriptional regulator  45.83 
 
 		 199 aa  50.8  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6034  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 223 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4138  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 385 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 257 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 201 aa  49.7  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1121  TetR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  26.92 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1253  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 200 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989157 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 197 aa  49.3  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 183 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 190 aa  49.3  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 220 aa  48.9  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3419  transcription regulation protein  27.27 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.909274  normal  0.462694 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 231 aa  48.5  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 190 aa  48.5  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1257  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 224 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1274  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 224 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.941811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1283  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 224 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20735  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2134  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 212 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 230 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  42.31 
 
 		 201 aa  48.5  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 194 aa  48.5  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  22.69 
 
 		 223 aa  48.5  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  20.9 
 
 		 310 aa  48.1  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>