More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2712 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2712  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  408  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 206 aa  95.5  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3459  putative transcriptional regulator  33.68 
 
 		 193 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40790  putative transcriptional regulator  33.68 
 
 		 193 aa  89  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0331  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3536  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 208 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0658  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1771  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0807  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2387  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1600  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1176  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1100  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2551  regulatory protein TetR  27.55 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140375  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9297  putative transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0120  transcription regulator protein  28.57 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3522  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  24.69 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3161  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3324  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5376  putative transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  28.97 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0474  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.542957  hitchhiker  4.20035e-18 
 
 
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NC_003909  BCE_4789  transcriptional regulator  24.52 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4787  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0422575  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4396  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  36.19 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4386  TetR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4770  transcriptional regulator, TetR family  24.52 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4761  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2310  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.145827  normal  0.0377448 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780559 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3035  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3290  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413178  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 291 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  28.05 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 189 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 242 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 278 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2148  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.726576 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 278 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 278 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 277 aa  52.4  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 202 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 214 aa  52.4  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 202 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 219 aa  52  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  37.38 
 
 		 239 aa  52  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 197 aa  51.6  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 194 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 192 aa  51.6  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 218 aa  51.6  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
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NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 220 aa  51.6  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
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NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 189 aa  51.6  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007520  Tcr_1702  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 197 aa  51.6  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS4551  transcriptional regulator, N-terminus  28.04 
 
 		 112 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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