More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0764 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  421  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 203 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 203 aa  152  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 248 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 204 aa  97.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 207 aa  92  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 200 aa  91.3  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 234 aa  89  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  25.21 
 
 		 307 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 333 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 208 aa  81.3  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 231 aa  78.2  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  25.24 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  28.91 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 238 aa  71.6  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  27.72 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3318  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.706239  normal  0.445875 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  31.51 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  25.49 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5095  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.666558  normal  0.638711 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 249 aa  64.7  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  24.14 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  25.79 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  29.91 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0641  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  25.42 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1551  hypothetical protein  26.4 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.494685  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 211 aa  62  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0292147 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1003  putative HTH-type transcriptional regulator  28.07 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  26.42 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  24.16 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  23.98 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01438  hypothetical protein  26.26 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004024  transcriptional regulator  26.26 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000690924  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 216 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1651  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.925362  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0439  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  20.73 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  21.86 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0805  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  25.12 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  21.89 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  26.74 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>