136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1651 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1651  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 255 aa  525  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.925362  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003710  transcriptional regulator  31.15 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.485423  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0855  transcriptional regulator, TetR family  22.71 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1609  transcriptional regulator, TetR family  25.12 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  19.39 
 
 		 214 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 210 aa  52.8  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 210 aa  52.8  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  21.47 
 
 		 208 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 212 aa  49.7  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  21.47 
 
 		 228 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  19.65 
 
 		 216 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 205 aa  48.9  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 213 aa  48.9  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 205 aa  48.5  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  20.86 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4472  transcriptional regulator, TetR family  48.89 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.590949  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3699  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 204 aa  47.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.158617  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 220 aa  47.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 		 275 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 196 aa  47  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0153  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 193 aa  46.6  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 217 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 217 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 200 aa  46.6  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  22.63 
 
 		 209 aa  46.6  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1560  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 		 221 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 217 aa  45.8  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3208  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 196 aa  45.8  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000777782  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 212 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 215 aa  45.8  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  22.93 
 
 		 192 aa  45.8  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 233 aa  45.8  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3453  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 		 196 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0161587  hitchhiker  4.69207e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3234  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 196 aa  45.4  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3140  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 196 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.404836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3487  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 196 aa  45.4  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.418737  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 207 aa  45.4  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  29.36 
 
 		 205 aa  45.4  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 307 aa  45.4  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3462  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 		 196 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00233938  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3448  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 		 196 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0055  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 196 aa  45.4  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.727514  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  17.88 
 
 		 206 aa  45.4  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0133  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 191 aa  45.4  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14044 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 216 aa  45.4  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 195 aa  45.4  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1013  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 		 196 aa  45.4  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 98 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 202 aa  45.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  21.15 
 
 		 205 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1893  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0175452  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 		 201 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0042  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 196 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 198 aa  44.3  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25800  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 212 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 205 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2735  TetR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.329672  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 202 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2204  putative transcriptional regulator  24.16 
 
 		 212 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 205 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 204 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  39.39 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  21.11 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 181 aa  43.5  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3809  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 208 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  21.67 
 
 		 196 aa  43.5  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 241 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  22.94 
 
 		 186 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 217 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 211 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 186 aa  43.5  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0267  HTH-type transcriptional regulator, tetR-family  23.64 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0450  transcriptional regulator, TetR family  20.47 
 
 		 213 aa  43.5  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.258482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  21.91 
 
 		 204 aa  43.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  20.83 
 
 		 295 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1913  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 226 aa  43.1  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000580043  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>