More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1913 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1913  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 226 aa  452  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000580043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0891  TetR family transcriptional regulator  78.38 
 
 		 227 aa  355  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.735718  normal  0.888939 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1531  TetR family transcriptional regulator  78.38 
 
 		 227 aa  354  5e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.357864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25800  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 212 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2204  putative transcriptional regulator  32 
 
 		 212 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4148  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 212 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1638  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 206 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.181149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1534  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 211 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114781  normal  0.468022 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1968  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000902359 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3822  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.526815  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3792  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.161831 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1499  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1657  regulatory protein, TetR  30.9 
 
 		 220 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3699  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.158617  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1609  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1681  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 216 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.977422 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0675  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 271 aa  52.4  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886772  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 201 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0915  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0153  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5146  transcriptional regulator PhaD  26.83 
 
 		 204 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5796  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 207 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0048122 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 203 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 233 aa  48.9  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 241 aa  48.9  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 211 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 201 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1515  regulatory protein, TetR  24.77 
 
 		 208 aa  48.5  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  48.5  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6699  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.678516  normal  0.427356 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1117  nucleoid occlusion protein  35.14 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.862438  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3521  nucleoid occlusion protein  30.59 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1283  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4387  nucleoid occlusion protein  36 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.449333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1789  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0144  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0237  transcriptional regulator  23.95 
 
 		 175 aa  47.8  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000134845  hitchhiker  0.00000000249443 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0144  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5006  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1460  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0391  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.799275  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  40.74 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2686  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4880  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1250  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 310 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6095  regulatory protein, TetR  37.7 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584059  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  35.94 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3217  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000141467  hitchhiker  0.00109998 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003710  transcriptional regulator  34.43 
 
 		 262 aa  46.6  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.485423  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2512  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290305  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0193  nucleoid occlusion protein  36.05 
 
 		 229 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3247  nucleoid occlusion protein  36.05 
 
 		 229 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3440  nucleoid occlusion protein  36.05 
 
 		 229 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0183  nucleoid occlusion protein  36.05 
 
 		 229 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.24476  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2181  nucleoid occlusion protein  36.05 
 
 		 229 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2908  nucleoid occlusion protein  36.05 
 
 		 229 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.946505  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3835  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3852  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1920  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0378  nucleoid occlusion protein  36.05 
 
 		 230 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.99909  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 240 aa  46.2  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1173  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 218 aa  45.8  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4417  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 207 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 231 aa  45.8  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 202 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 195 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>