More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3699 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3699  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  410  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.158617  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0153  TetR family transcriptional regulator  67.02 
 
 		 193 aa  259  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  62.94 
 
 		 205 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5887  TetR family transcriptional regulator  58.25 
 
 		 212 aa  238  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825874 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1789  TetR family transcriptional regulator  56.06 
 
 		 210 aa  209  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1173  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 218 aa  191  5e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  51.98 
 
 		 210 aa  190  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  51.98 
 
 		 210 aa  190  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6095  regulatory protein, TetR  40.2 
 
 		 204 aa  167  9e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584059  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0133  TetR family transcriptional regulator  51.98 
 
 		 191 aa  158  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14044 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1681  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.977422 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2399  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2440  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2446  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200805  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1913  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000580043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 286 aa  55.1  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 186 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  42.67 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  42.67 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  28.17 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 217 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0411  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.3269  hitchhiker  0.00212654 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0891  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 227 aa  52.4  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.735718  normal  0.888939 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 253 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  37.89 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  23.49 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2292  intercellular adhesion regulator  26.55 
 
 		 185 aa  52  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0364892  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  48.94 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1531  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 227 aa  52  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.357864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0414  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 209 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 198 aa  51.6  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 222 aa  51.6  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  29.05 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0394  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509635  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  28.57 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1649  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279043 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 291 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 256 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3329  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000330103  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3722  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1503  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0825242 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  46 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0626  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  40.54 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 385 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>