More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4429 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  393  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2591  transcriptional regulator, TetR family  39.15 
 
 		 192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0120  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.654836  normal  0.0157031 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  31.48 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 208 aa  67  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  24.85 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  22.89 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 234 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3274  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  29.88 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  28.41 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  21.57 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  32.67 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  22.29 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  29.75 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  30.54 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1501  regulatory protein TetR  31.21 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0856799  normal  0.774912 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 216 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  24.66 
 
 		 197 aa  53.9  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  57.45 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 231 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4967  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110994  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1422  transcriptional regulator, TetR family  26.28 
 
 		 223 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  24.69 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2263  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.89343 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6137  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.780623 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  26.28 
 
 		 225 aa  52.4  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 235 aa  52  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 214 aa  52  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 195 aa  51.6  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 		 230 aa  51.6  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  24.84 
 
 		 190 aa  51.6  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1611  regulatory protein TetR  29.17 
 
 		 222 aa  52  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.993172  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0414  regulatory protein TetR  43.59 
 
 		 231 aa  52  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.580547  normal  0.438724 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 207 aa  51.6  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5551  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 203 aa  51.2  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.1306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 210 aa  51.2  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4723  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 230 aa  51.2  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  25.32 
 
 		 217 aa  51.2  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 206 aa  51.2  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 223 aa  50.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  21.21 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  20.61 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 184 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 193 aa  50.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0395  transcriptional regulator  21.79 
 
 		 175 aa  50.4  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  26.22 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 206 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  25.9 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  21.35 
 
 		 208 aa  49.7  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  24.34 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3395  transcriptional regulator, TetR family  54.76 
 
 		 173 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>