More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0309 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 213 aa  424  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  46.67 
 
 		 184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 174 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  46.85 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 291 aa  105  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 222 aa  99.4  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 255 aa  90.9  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  36.16 
 
 		 230 aa  89  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 183 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 191 aa  87  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  37.58 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1681  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.371055  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 180 aa  74.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 193 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 193 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 193 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0973  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 201 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27950  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00827834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1976  putative transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 318 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 318 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 316 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 318 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 318 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 316 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 316 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 317 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0312  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000380117  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 183 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 263 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5621  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00254336 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  40.32 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  30.91 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1070  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 229 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 232 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  34.52 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2192  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4341  putative transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.13823  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2311  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2800  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1502  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.385487  normal  0.318035 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 216 aa  52.4  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4794  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 187 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 222 aa  52.4  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0758  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 197 aa  52.4  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5760  putative transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1256  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>