More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2636 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 198 aa  408  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3014  TetR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4067  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 191 aa  89  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200915  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4231  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 191 aa  88.6  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2903  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 191 aa  87.4  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.281452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4114  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 191 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3955  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 191 aa  86.7  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.915843  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4434  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 191 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4342  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 191 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4287  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 191 aa  84.7  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3966  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0106  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156451  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0910  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00546748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4323  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2292  intercellular adhesion regulator  30.77 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0364892  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2689  TetR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2746  regulatory protein TetR  46.97 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2965  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0278757  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0370  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4046  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2195  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1873  hypothetical protein  47.54 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.667872  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  48.15 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  24.35 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3421  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.257842 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2329  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143879 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5006  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3241  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4869  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0455  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0937341  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2192  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2820  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  25.49 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3420  putative transcriptional regulator, TetR family  21.68 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.908094  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0503  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  46.67 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4880  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  20.73 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  31.2 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0503  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 497 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  23.84 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  25.64 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  23.84 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5146  transcriptional regulator PhaD  32.95 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  21.88 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.58 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  22.62 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  25.15 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  41.51 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>