More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5551 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5551  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  417  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.1306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  73.76 
 
 		 202 aa  304  7e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  73.47 
 
 		 205 aa  299  2e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3160  TetR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 205 aa  144  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000883166 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5380  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 197 aa  93.6  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768843  normal  0.61228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  29.26 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 230 aa  74.7  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  51.67 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  59.18 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  30.83 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  29.09 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 190 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 213 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 287 aa  54.3  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4804  transcriptional regulator, TetR family  26.99 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.120851  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  32.97 
 
 		 224 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 223 aa  52.8  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 231 aa  52.8  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 185 aa  52  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3905  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 211 aa  52  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 291 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 183 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 204 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 233 aa  51.6  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 202 aa  51.6  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 202 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 201 aa  51.6  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 218 aa  51.6  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 204 aa  51.6  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  23.89 
 
 		 205 aa  51.6  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  28.93 
 
 		 200 aa  51.2  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 192 aa  51.2  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  27.91 
 
 		 196 aa  51.2  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 195 aa  51.6  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 229 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 271 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  25.88 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  25.13 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  44.68 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  35.53 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  21.98 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  33.95 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0974  TetR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  24.47 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3101  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0986  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  41.25 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  34.52 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1772  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.706828  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>