More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2515 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  414  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5551  TetR family transcriptional regulator  73.76 
 
 		 203 aa  304  8.000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.1306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  70.47 
 
 		 205 aa  280  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3160  TetR family transcriptional regulator  42.78 
 
 		 205 aa  153  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000883166 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5380  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 197 aa  99.8  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768843  normal  0.61228 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  28.04 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 243 aa  68.2  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 205 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 287 aa  62  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3905  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 291 aa  58.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1561  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  27.53 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  37.39 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  29.12 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  26.99 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  28.26 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  28.68 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1668  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  27.13 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 218 aa  53.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 223 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  32.93 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 280 aa  53.9  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0162  transcription regulator protein  27.65 
 
 		 233 aa  52.8  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3014  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1121  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6827  putative transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 217 aa  52.4  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0813  AcrR/TetR family transcription regulator  23.04 
 
 		 227 aa  52.4  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0716  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281964  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 232 aa  52.8  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  27.1 
 
 		 310 aa  52.4  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 291 aa  52.4  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2292  intercellular adhesion regulator  23.78 
 
 		 185 aa  52  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0364892  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 218 aa  52  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06539  hypothetical protein  23.53 
 
 		 218 aa  52  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  44.59 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4804  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.120851  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0626  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1833  regulatory protein, TetR  26.85 
 
 		 236 aa  52  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 222 aa  51.6  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0493  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 206 aa  51.6  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0971  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>