More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0042 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
219 aa  448  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  48.37 
 
 
231 aa  219  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1778  TetR family transcriptional regulator  48.79 
 
 
250 aa  210  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677686  unclonable  0.000000000627047 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4891  transcriptional regulator, TetR family  47.83 
 
 
261 aa  206  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164408  normal  0.287477 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3356  TetR family transcriptional regulator  49.28 
 
 
247 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000224117 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
245 aa  139  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 
230 aa  136  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4330  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
235 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0051  transcriptional regulator, TetR family  38.29 
 
 
250 aa  121  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  33.81 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 
244 aa  119  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0054  transcriptional regulator, TetR family  38.53 
 
 
250 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  33.81 
 
 
232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0162  transcription regulator protein  36.82 
 
 
233 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1718  TetR family transcriptional regulator  38.61 
 
 
228 aa  101  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.114077  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  48.72 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 
203 aa  68.6  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 
203 aa  68.6  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  43.9 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  43.9 
 
 
204 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  43.9 
 
 
204 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 
203 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  44.05 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  46.97 
 
 
207 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1121  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 
221 aa  64.3  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21800  transcriptional regulator  36.52 
 
 
265 aa  63.5  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.391718  normal  0.223847 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
192 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  34.35 
 
 
206 aa  62  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
238 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2710  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
203 aa  60.5  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.466457  normal  0.498996 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 
202 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 
207 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177797 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1000  regulatory protein, TetR  30.32 
 
 
242 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 
220 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
227 aa  60.1  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
209 aa  59.3  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2162  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
207 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116975  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 
207 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 
211 aa  59.3  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
209 aa  59.3  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 
226 aa  59.3  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
191 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
209 aa  59.3  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
240 aa  59.3  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
207 aa  59.3  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0973  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 
198 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
238 aa  58.9  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 
332 aa  58.5  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
216 aa  58.5  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2373  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 
207 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2880  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
195 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 
232 aa  58.5  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  41.18 
 
 
184 aa  58.2  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1158  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 
218 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91676  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
207 aa  58.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 
214 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 
194 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
202 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  47.89 
 
 
246 aa  58.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  44.58 
 
 
198 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
205 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  37.78 
 
 
217 aa  57  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  53.7 
 
 
210 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  53.7 
 
 
210 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  53.7 
 
 
210 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2506  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 
205 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.733789  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  30.07 
 
 
239 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2441  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
205 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.21008  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 
232 aa  56.2  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6034  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
223 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 
231 aa  56.6  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 
220 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
234 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3665  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 
228 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
234 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4020  TetR family transcriptional regulator  46.05 
 
 
258 aa  56.2  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12217  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 
291 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
211 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5551  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 
203 aa  55.8  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.1306  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 
205 aa  56.2  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 
242 aa  55.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
211 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 
221 aa  55.5  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
211 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  37.04 
 
 
211 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  37.04 
 
 
211 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2447  TetR family transcriptional regulator  54.9 
 
 
208 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 
204 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  37.04 
 
 
211 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  37.04 
 
 
211 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  37.04 
 
 
211 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03010  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
222 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000381229 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  37.04 
 
 
211 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4322  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 
242 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
222 aa  55.1  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  33.65 
 
 
219 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  34.58 
 
 
223 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  28.98 
 
 
196 aa  55.1  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
216 aa  55.1  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
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NC_007908  Rfer_3897  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
213 aa  55.1  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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