More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_26800 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  100 
 
 		 184 aa  366  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  51.69 
 
 		 185 aa  169  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 174 aa  162  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 213 aa  130  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 222 aa  112  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  38.01 
 
 		 255 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  44.52 
 
 		 186 aa  99  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  43.15 
 
 		 230 aa  99  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 176 aa  92.8  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 191 aa  86.3  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0973  TetR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 198 aa  85.5  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 185 aa  84.3  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 291 aa  81.6  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 180 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1681  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.371055  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 332 aa  71.6  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1976  putative transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 183 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  34.62 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0051  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 250 aa  57.8  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 217 aa  57.8  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0054  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 250 aa  57.8  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4757  regulatory protein, TetR  36.84 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0842681 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 212 aa  57  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  25.33 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1594  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000148614  unclonable  0.000000209189 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3798  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164802  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3794  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.549336  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3867  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0211824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0312  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000380117  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0102  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.478027 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4186  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  23.91 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2030  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0233695  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0462  putative transcriptional regulator  33.93 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3966  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  38.16 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0106  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156451  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4342  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04820  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  40.26 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4287  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  29.05 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4114  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3955  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.915843  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4434  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 232 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 244 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 200 aa  54.3  0.0000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4067  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  54.3  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200915  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 211 aa  54.3  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 228 aa  54.3  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4323  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3900  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.113348  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 219 aa  53.9  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1320  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767739  normal  0.281979 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 197 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 244 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3705  regulatory protein TetR  31.08 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  31.86 
 
 		 346 aa  54.3  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3239  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1088  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1985  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  35.71 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4217  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.152492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>