More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3794 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3794  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.549336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3867  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0211824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3798  TetR family transcriptional regulator  97.91 
 
 		 191 aa  343  6e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164802  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4249  TetR family transcriptional regulator  67.03 
 
 		 191 aa  219  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.399807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  41.34 
 
 		 191 aa  118  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 194 aa  105  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1681  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 217 aa  101  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.371055  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  35.59 
 
 		 201 aa  85.9  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0973  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 255 aa  78.6  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  34.31 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 174 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3664  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 182 aa  62  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  42.67 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4041  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  normal  0.0505107 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 332 aa  57  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 291 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  43.33 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  48.15 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1329  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.851315 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 234 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 243 aa  54.3  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  34.03 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3219  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1604  AcrR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 221 aa  53.1  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388293  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 231 aa  53.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1206  regulatory protein TetR  41.03 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 189 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  46 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 214 aa  52.4  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2734  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 225 aa  52  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  32.06 
 
 		 203 aa  52  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25800  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 199 aa  52  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2204  putative transcriptional regulator  40.54 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 208 aa  51.6  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 217 aa  51.6  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  37.86 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40790  putative transcriptional regulator  35.79 
 
 		 193 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 243 aa  51.6  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 219 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  37.86 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  37.86 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  37.86 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  37.86 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  37.86 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  35.16 
 
 		 217 aa  51.6  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 194 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 209 aa  51.2  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 219 aa  51.2  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2216  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 189 aa  51.2  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191802  normal  0.0189795 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 199 aa  51.2  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  51.2  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 219 aa  51.2  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 237 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3035  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.514093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40 
 
 		 213 aa  50.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 310 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 222 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 291 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 		 286 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>