More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BT9727_3955 on replicon NC_005957
Organism: Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS4114  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
191 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3955  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
191 aa  392  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.915843  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4434  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
191 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4231  transcriptional regulator, TetR family  98.95 
 
 
191 aa  390  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4342  transcriptional regulator, TetR family  94.24 
 
 
191 aa  373  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4287  TetR family transcriptional regulator  93.72 
 
 
191 aa  372  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3966  TetR family transcriptional regulator  93.72 
 
 
191 aa  372  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4067  TetR family transcriptional regulator  92.67 
 
 
191 aa  370  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200915  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0910  transcriptional regulator, TetR family  93.19 
 
 
191 aa  354  5e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00546748  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4323  transcriptional regulator, TetR family  93.19 
 
 
191 aa  353  1e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2903  TetR family transcriptional regulator  87.37 
 
 
191 aa  347  8e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.281452  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3014  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0106  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
214 aa  115  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156451  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 
198 aa  86.7  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3506  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0158634  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  47.44 
 
 
222 aa  65.9  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
212 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4703  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 
182 aa  59.3  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137172  normal  0.288801 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
212 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
212 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03740  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 
221 aa  58.5  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
197 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  38.96 
 
 
220 aa  56.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 
207 aa  55.5  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  36.25 
 
 
184 aa  55.1  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  41.98 
 
 
193 aa  55.1  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
212 aa  55.1  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 
205 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
200 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
234 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2477  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 
190 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3907  regulatory protein TetR  48.94 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  27.21 
 
 
247 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  32.98 
 
 
400 aa  53.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
218 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
217 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
197 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
273 aa  52  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 
255 aa  52  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 
186 aa  52  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
192 aa  52  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
219 aa  52  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
191 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 
210 aa  51.6  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 
233 aa  51.6  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
209 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 
189 aa  51.2  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 
221 aa  51.2  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 
183 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0051  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 
250 aa  51.2  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0054  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 
250 aa  51.6  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 
202 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 
210 aa  50.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1186  transcriptional regulator, TetR family  51.06 
 
 
206 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 
214 aa  50.4  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 
225 aa  50.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3182  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 
207 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
191 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3621  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 
203 aa  50.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  52.17 
 
 
195 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 
174 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3183  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 
207 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3326  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 
207 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  21.39 
 
 
191 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5542  transcriptional regulator, TetR family  52.5 
 
 
194 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.789571  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
216 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 
197 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 
205 aa  50.1  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 
192 aa  50.1  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3140  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
197 aa  49.7  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137738  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 
266 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  43.1 
 
 
201 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1072  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 
206 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000136093  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1144  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 
206 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00178929  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
224 aa  49.7  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 
220 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
212 aa  49.7  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 
221 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
215 aa  49.3  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2195  transcriptional regulator, TetR family  46.81 
 
 
189 aa  49.3  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1096  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 
192 aa  49.3  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 
317 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 
203 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
210 aa  49.7  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0162  transcription regulator protein  22.06 
 
 
233 aa  49.3  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  53.33 
 
 
204 aa  48.9  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3984  transcriptional regulator, TetR family protein  36.05 
 
 
211 aa  48.9  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
206 aa  48.9  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5046  putative transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 
193 aa  48.5  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373913  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 
216 aa  48.5  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 
271 aa  48.9  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  24.53 
 
 
223 aa  48.9  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  43.1 
 
 
230 aa  48.9  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 
225 aa  48.5  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
248 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 
201 aa  48.5  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 
205 aa  48.5  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1567  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 
202 aa  48.5  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.246189  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
215 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  24.65 
 
 
214 aa  48.5  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>