60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4703 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4703  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 182 aa  367  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137172  normal  0.288801 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3506  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 199 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0158634  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4287  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4067  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200915  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3966  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4342  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2903  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.281452  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4323  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0910  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 191 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00546748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3014  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4114  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3955  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.915843  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4434  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4231  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  53.66 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  34.35 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 240 aa  47  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 204 aa  45.1  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 191 aa  44.7  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0106  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 214 aa  44.7  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156451  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 212 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 243 aa  43.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 253 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 232 aa  42.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0411  transcriptional regulator, TetR family  54.55 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.3269  hitchhiker  0.00212654 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 214 aa  42.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  43.59 
 
 		 203 aa  42.4  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  46.34 
 
 		 215 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 223 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  25.89 
 
 		 193 aa  42  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  53.66 
 
 		 202 aa  42.4  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 233 aa  42.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27950  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 207 aa  42  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00827834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 203 aa  42  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 183 aa  42  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2195  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 189 aa  42  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 208 aa  41.6  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2292  intercellular adhesion regulator  36.73 
 
 		 185 aa  41.6  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0364892  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 200 aa  41.2  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 257 aa  41.6  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  43.24 
 
 		 208 aa  41.2  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2260  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 214 aa  41.6  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0561114  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 216 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 203 aa  41.2  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 216 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 200 aa  41.2  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 209 aa  41.2  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 216 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4123  TetR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 204 aa  41.2  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 221 aa  41.2  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 189 aa  41.2  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3277  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 188 aa  41.2  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 227 aa  40.8  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 98 aa  40.8  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  51.35 
 
 		 231 aa  40.8  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>