More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_2903 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2903  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
191 aa  393  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.281452  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4067  TetR family transcriptional regulator  86.84 
 
 
191 aa  348  4e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200915  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4114  TetR family transcriptional regulator  87.37 
 
 
191 aa  347  8e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3955  TetR family transcriptional regulator  87.37 
 
 
191 aa  347  8e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.915843  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4434  TetR family transcriptional regulator  87.37 
 
 
191 aa  347  8e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4231  transcriptional regulator, TetR family  86.32 
 
 
191 aa  344  5e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4287  TetR family transcriptional regulator  86.32 
 
 
191 aa  341  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4342  transcriptional regulator, TetR family  86.32 
 
 
191 aa  342  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3966  TetR family transcriptional regulator  85.79 
 
 
191 aa  339  1e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0910  transcriptional regulator, TetR family  86.84 
 
 
191 aa  330  5e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00546748  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4323  transcriptional regulator, TetR family  86.39 
 
 
191 aa  330  9e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3014  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
195 aa  138  6e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0106  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 
214 aa  120  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156451  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 
198 aa  87.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3506  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
199 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0158634  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4703  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
182 aa  62.8  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137172  normal  0.288801 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  52.63 
 
 
222 aa  60.8  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 
193 aa  58.5  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  41.67 
 
 
220 aa  56.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
212 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
212 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
212 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03740  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 
221 aa  55.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 
212 aa  55.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 
207 aa  55.1  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 
202 aa  54.7  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
197 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 
219 aa  54.7  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 
189 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 
247 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 
225 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3907  regulatory protein TetR  29.86 
 
 
212 aa  53.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  22.46 
 
 
191 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
255 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  34.57 
 
 
184 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2477  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 
190 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3428  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 
223 aa  52.4  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0832031  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6809  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 
178 aa  52  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.318139  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
218 aa  51.6  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 
190 aa  51.6  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
211 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
233 aa  51.2  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
204 aa  51.2  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 
190 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 
210 aa  50.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1394  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 
214 aa  50.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 
203 aa  50.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3326  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 
207 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
216 aa  50.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5542  transcriptional regulator, TetR family  52.5 
 
 
194 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.789571  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
201 aa  50.4  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1186  transcriptional regulator, TetR family  51.06 
 
 
206 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 
317 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1072  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 
206 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000136093  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1144  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00178929  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3182  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 
207 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3183  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 
207 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 
234 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 
214 aa  50.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  52.17 
 
 
195 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 
221 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 
271 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
205 aa  50.4  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3310  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 
205 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0639272  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
203 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  55 
 
 
192 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
200 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 
210 aa  50.1  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
191 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 
218 aa  49.7  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5717  transcriptional regulator, TetR family  25.36 
 
 
156 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 
204 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 
239 aa  48.9  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3140  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 
197 aa  48.9  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137738  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 
183 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3984  transcriptional regulator, TetR family protein  51.11 
 
 
211 aa  48.9  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 
206 aa  48.9  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
217 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
197 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 
209 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 
230 aa  49.3  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 
273 aa  48.5  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7312  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 
210 aa  48.9  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3093  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 
201 aa  48.9  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0252517 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  24.52 
 
 
223 aa  48.5  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 
186 aa  48.9  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3621  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 
203 aa  48.9  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 
208 aa  48.5  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
212 aa  48.5  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 
205 aa  48.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 
225 aa  48.1  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
197 aa  48.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 
208 aa  48.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 
203 aa  48.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 
231 aa  48.1  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 
209 aa  48.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2260  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 
214 aa  48.1  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0561114  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4046  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 
222 aa  48.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  25.57 
 
 
209 aa  48.1  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3305  TetR family transcriptional regulator  51.22 
 
 
195 aa  47.8  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>