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for query gene Rfer_0400 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  416  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_0153  TetR family transcriptional regulator  61.98 
 
 		 193 aa  257  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3699  TetR family transcriptional regulator  62.94 
 
 		 204 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.158617  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1789  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 210 aa  218  7e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5887  TetR family transcriptional regulator  50.24 
 
 		 212 aa  197  7.999999999999999e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825874 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1173  TetR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 218 aa  183  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6095  regulatory protein, TetR  40.91 
 
 		 204 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584059  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  48.51 
 
 		 210 aa  171  5e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 210 aa  171  9e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0133  TetR family transcriptional regulator  50.56 
 
 		 191 aa  155  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14044 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 203 aa  85.1  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1681  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 216 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.977422 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  26.02 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  32.03 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3273  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.346529  normal  0.756983 
 
 
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NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  52.94 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
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NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  25.74 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
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NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
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NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
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NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 235 aa  58.2  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
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NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  40.23 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3569  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
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NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
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NC_011004  Rpal_3896  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
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NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  38.54 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_1913  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000580043  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  30.07 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_3453  transcriptional regulator TetR family  28.29 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007005  Psyr_0675  regulatory protein, TetR  24.26 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013421  Pecwa_1188  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_0639  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307578  hitchhiker  0.000146714 
 
 
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NC_002947  PP_0594  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 247 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0201579  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0771  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.353788  n/a   
 
 
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NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 216 aa  53.9  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
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NC_007912  Sde_3722  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 189 aa  54.7  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 186 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 218 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0634  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000435144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 187 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  47.17 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  26.28 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 324 aa  53.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 261 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 213 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  43.86 
 
 		 226 aa  52.8  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_4602  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.904797 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
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NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  40.74 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
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NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
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NC_009720  Xaut_0626  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010501  PputW619_4569  TetR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000245113  hitchhiker  0.00602594 
 
 
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