More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_27950 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_27950  transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  432  1e-120  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00827834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  32.84 
 
 		 203 aa  125  5e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0337  transcriptional regulator, TetR family  35.78 
 
 		 204 aa  118  4.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2627  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 202 aa  117  7.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108473  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4031  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 203 aa  112  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4628  transcriptional regulator, TetR family  30.24 
 
 		 206 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000955982  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1939  transcriptional regulator, TetR family  30.35 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.640559  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0339  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 205 aa  101  7e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0312  transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 203 aa  98.6  6e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.041978  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1606  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 225 aa  91.7  7e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.912424  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25680  transcriptional regulator  26.06 
 
 		 203 aa  90.9  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  28.87 
 
 		 197 aa  89.4  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2311  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 235 aa  84.7  8e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28270  transcriptional regulator  25.13 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.188874 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1489  transcriptional regulator, TetR family  27.36 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0820  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0110693  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2005  hypothetical protein  22.22 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0591138  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  27.59 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03670  transcriptional regulator  24.75 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00912022  hitchhiker  0.0085588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0312  transcriptional regulator, TetR family  23.89 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000380117  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2316  transcriptional regulator, TetR family  22.39 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.166278  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1181  TetR family transcriptional regulator  21.05 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4215  TetR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4281  TetR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.439471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4442  TetR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3060  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0482313 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1953  TetR family transcriptional regulator  19.12 
 
 		 213 aa  53.1  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.957288  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3467  TetR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 228 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5376  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 445 aa  52.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2354  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 184 aa  52  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 198 aa  52  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  28.28 
 
 		 198 aa  51.6  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 174 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2456  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0797268  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_003296  RS05643  putative transcription regulator protein  26.83 
 
 		 233 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4122  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  29.29 
 
 		 182 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1502  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.385487  normal  0.318035 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 204 aa  48.9  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 200 aa  48.5  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 408 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1641  transcriptional regulator, TetR family protein  32.18 
 
 		 145 aa  48.5  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.216203  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 200 aa  48.5  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1444  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 225 aa  48.1  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0101817  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0532  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 424 aa  48.1  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  22.75 
 
 		 216 aa  48.1  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2600  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 185 aa  48.1  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4366  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 211 aa  48.1  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00655225  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2654  regulatory protein TetR  32.1 
 
 		 185 aa  48.1  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  36.21 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 185 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1468  TetR family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 260 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2120  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3406  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 185 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 385 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3506  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0158634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0411  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.3269  hitchhiker  0.00212654 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3241  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 221 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 424 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1965  TetR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  25.96 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10234  TetR/AcrR family transcriptional regulator  22.37 
 
 		 229 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1602  transcriptional regulator, TetR family  25.18 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4096  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.428343  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2165  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03740  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1694  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0960426 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 223 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  40.35 
 
 		 230 aa  46.2  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0559  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 451 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 410 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>