More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2085 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 210 aa  434  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 224 aa  86.7  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  29.37 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 217 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  25.19 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 324 aa  65.1  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 184 aa  64.3  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3621  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2311  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3563  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473219 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 205 aa  62  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3465  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 248 aa  62  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.980317  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3241  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 258 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1976  putative transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 181 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  40.91 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1620  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0021024  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  24.68 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  22.58 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  25.23 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  25.69 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0258  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.569121  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3827  putative transcriptional regulator  25.71 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  24.68 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0736  transcriptional regulator  22.97 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0112088  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5241  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5031  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44980  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0815  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4589  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.954889 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  58.2  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1100  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  27.57 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  27.2 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  24.23 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>