More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2353 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  435  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  94.44 
 
 		 217 aa  391  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  93.52 
 
 		 217 aa  387  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  93.52 
 
 		 217 aa  388  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  90.32 
 
 		 217 aa  384  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  90.32 
 
 		 217 aa  384  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  92.13 
 
 		 217 aa  381  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  91.24 
 
 		 217 aa  382  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  91.67 
 
 		 217 aa  382  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  91.67 
 
 		 217 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  51.16 
 
 		 222 aa  239  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  50.95 
 
 		 217 aa  229  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  45.97 
 
 		 224 aa  204  6e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 218 aa  138  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0736  transcriptional regulator  32.53 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0112088  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0016  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 216 aa  95.5  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0258  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.569121  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0180  TetR/AcrR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0296493  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0183  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  24.19 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  25.24 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  27.62 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0212  transcription regulator TetR/AcrR family protein  30.92 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 173 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 243 aa  65.1  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  26.96 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0194  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0976  regulatory protein TetR  48.15 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00018682  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  22.96 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1177  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0995  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  51.92 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  26.18 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  55.17 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0991  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1237  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0986  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13181  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000106336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1159  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  25.12 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5463  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3861  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5585  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  22.95 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 286 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>