More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1971 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 196 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  76.92 
 
 		 205 aa  323  1e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  82.72 
 
 		 212 aa  318  5e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  82.72 
 
 		 212 aa  318  5e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  75.9 
 
 		 204 aa  317  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 200 aa  135  5e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  24.37 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2103  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0986  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2735  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 201 aa  72  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0016  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 217 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  29.6 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  29.6 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  32.21 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4596  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 421 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.227831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  29.6 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1808  TetR family transcriptional regulator  55.36 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  29.86 
 
 		 423 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 414 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 218 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1649  TetR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 233 aa  62  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 224 aa  62  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 203 aa  62  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 207 aa  62  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3651  TetR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  26.98 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2181  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000940073  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4298  transcriptional regulator, TetR family  53.57 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.530374  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1177  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8904  putative transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2332  regulatory protein, TetR  30.43 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376775  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0991  TetR family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1237  transcriptional regulator, TetR family  22.89 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1159  transcriptional regulator, TetR family  22.89 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  25.16 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  24.37 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0500  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  22.39 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6309  putative transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.407991  normal  0.0813971 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007964  Nham_2701  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
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NC_008148  Rxyl_0440  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
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NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_006274  BCZK0995  TetR family transcriptional regulator  22.39 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  22.39 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  22.39 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  25.74 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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