More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3694 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  453  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2192  TetR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4114  TetR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3955  TetR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.915843  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4434  TetR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1070  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13181  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000106336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4231  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 191 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4067  TetR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 191 aa  64.7  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200915  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0910  transcriptional regulator, TetR family  54.39 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00546748  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4287  TetR family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3966  TetR family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4323  transcriptional regulator, TetR family  54.39 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4342  transcriptional regulator, TetR family  54.39 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 200 aa  62  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 203 aa  62  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  39.24 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2767  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0855812  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2903  TetR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.281452  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1746  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4638  putative transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.856697 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2437  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  35.21 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  38.82 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1600  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0652187  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  29.37 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 200 aa  58.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3827  putative transcriptional regulator  44.26 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1799  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.539023  normal  0.822653 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0054  transcriptional regulator, TetR family  28.15 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0051  transcriptional regulator, TetR family  28.15 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44980  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  46.27 
 
 		 186 aa  58.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4295  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2292  intercellular adhesion regulator  36.62 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0364892  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3698  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  23.46 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1777  regulatory protein, TetR  40.98 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.26768  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3641  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1574  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00597987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3860  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.526451  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  38.55 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0008  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.643837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3620  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  41.94 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7459  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2689  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5974  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0426648  hitchhiker  0.00085933 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1833  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  41.94 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>