More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4638 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4638  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 196 aa  396  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.856697 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7911  transcriptional regulator, TetR family  47.89 
 
 		 188 aa  167  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0417125  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 		 205 aa  90.5  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2778  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0630256 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1550  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.147371  normal  0.894594 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03740  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  33.64 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23280  transcriptional regulator, TetR family  25.98 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19280  transcriptional regulator  38.24 
 
 		 235 aa  54.7  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.28299  normal  0.286722 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 218 aa  53.9  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 223 aa  52.8  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 222 aa  52  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 221 aa  52  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 214 aa  51.6  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 247 aa  51.6  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 247 aa  51.6  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  35.37 
 
 		 230 aa  50.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1158  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91676  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 225 aa  49.7  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3108  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  50.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1000  regulatory protein, TetR  29.03 
 
 		 242 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 260 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2904  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.349703 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1526  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 226 aa  48.9  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 198 aa  48.9  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 226 aa  48.9  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 219 aa  48.9  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  44.16 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 225 aa  48.9  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 214 aa  48.9  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 228 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0312  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 206 aa  48.5  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000380117  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 243 aa  48.5  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1692  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 224 aa  48.5  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 190 aa  48.5  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 245 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 222 aa  48.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 220 aa  48.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 198 aa  48.5  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1313  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 231 aa  48.1  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1365  transcriptional regulator  27.36 
 
 		 211 aa  48.1  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.575727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 205 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 197 aa  48.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 208 aa  47.8  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 196 aa  48.1  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 221 aa  48.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 198 aa  48.1  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  31.15 
 
 		 241 aa  48.1  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3834  transcriptional regulator, TetR family  26.39 
 
 		 218 aa  48.1  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5635  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0445849  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6452  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 264 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  26.62 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 246 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3140  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 224 aa  47.4  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 228 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3562  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 226 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 227 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 228 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 278 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  41.56 
 
 		 326 aa  46.6  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>