More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_14700 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 207 aa  409  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 193 aa  64.7  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 190 aa  64.7  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 242 aa  61.6  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 230 aa  61.6  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  54.17 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5635  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0445849  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3448  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  30.77 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1083  TetR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0891  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6395  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2354  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0622512  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2530  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.828016  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 324 aa  58.2  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7226  putative transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3094  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5273  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5162  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122941 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  44.29 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4995  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0377  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4633  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2312  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2270  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2545  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.91976e-46 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2820  transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  29.01 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1689  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0605741  hitchhiker  0.00000000000000310562 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4577  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1884  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.543413  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0556  putative transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00669649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0245  transcriptional regulator  27.86 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3411  transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2347  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123383  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6717  transcriptional regulator, TetR family  53.7 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.477187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7126  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6309  putative transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.407991  normal  0.0813971 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>