More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3003 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  99.02 
 
 		 204 aa  401  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  77.11 
 
 		 206 aa  330  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  70.71 
 
 		 207 aa  303  9.000000000000001e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  44.39 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 198 aa  152  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  42.56 
 
 		 203 aa  147  9e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  42.13 
 
 		 205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 198 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 220 aa  137  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 205 aa  137  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  38.66 
 
 		 196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  41.21 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  37.26 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0576  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  40.41 
 
 		 228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  38.19 
 
 		 211 aa  118  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  35.55 
 
 		 209 aa  111  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28140  transcriptional regulator  37.14 
 
 		 216 aa  105  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 197 aa  105  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 185 aa  104  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0641  TetR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109704  normal  0.126118 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  35.6 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 235 aa  102  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  34.9 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 227 aa  100  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0472  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 193 aa  98.2  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.957077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0483  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 193 aa  98.2  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0459  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 193 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 208 aa  94.7  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1733  transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 		 213 aa  92.8  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446931  hitchhiker  0.00691691 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  32 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3080  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0935243  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0463  transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3055  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4666  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.243183 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  47.3 
 
 		 189 aa  62  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4918  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1758  transcriptional regulator of TetR family protein  37.21 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.77056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1778  TetR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677686  unclonable  0.000000000627047 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06539  hypothetical protein  40 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4891  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164408  normal  0.287477 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  37.5 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  34.78 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2064  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3662  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2751  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  22.95 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3188  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2880  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0051  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  35.71 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 229 aa  54.7  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0054  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 250 aa  54.7  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
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NC_008782  Ajs_4020  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 258 aa  54.3  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12217  normal  1 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 244 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
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NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
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