More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1191 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  450  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 234 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 219 aa  237  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  49.76 
 
 		 217 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 217 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  49.05 
 
 		 219 aa  218  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  49.05 
 
 		 219 aa  218  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  49.05 
 
 		 219 aa  218  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 258 aa  215  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  47.26 
 
 		 204 aa  201  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3581  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1298  transcriptional regulator TetR family  28.8 
 
 		 235 aa  86.7  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2483  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0489732  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2354  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0622512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2312  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2270  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1689  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0605741  hitchhiker  0.00000000000000310562 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2530  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.828016  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2545  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.91976e-46 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1746  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227148  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2889  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00514184  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3981  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000890193 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  25.6 
 
 		 214 aa  62  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  45.59 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4502  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.595773 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  36.36 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3896  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.971829  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  30.84 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5516  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5749  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3200  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 235 aa  58.2  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  32.85 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  40.48 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  30.95 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0511  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  44.07 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0176  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 289 aa  55.5  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  41.38 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6827  putative transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 199 aa  54.7  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  40.74 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  24.75 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  40.3 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  33.03 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4773  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164473  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0744  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1746  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3584  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1727  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113561  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>