More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0511 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0511  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 225 aa  450  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13490  transcriptional regulator  45.85 
 
 		 213 aa  156  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4369  transcriptional regulator, TetR family  44.16 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1307  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 212 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0245614  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0757  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106421  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1882  regulatory protein TetR  28.27 
 
 		 204 aa  71.6  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0460  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466873  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1640  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 216 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4802  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.96494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3750  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3697  regulatory protein, TetR  26.84 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 198 aa  62  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1444  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0101817  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3117  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8998  putative transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1633  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.124131  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 218 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3293  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000151669  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 204 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2064  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  36.36 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 189 aa  53.5  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04360  transcriptional regulator  46.15 
 
 		 194 aa  53.5  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  25.59 
 
 		 226 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0081  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 197 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  46.77 
 
 		 213 aa  53.1  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3349  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 209 aa  52.8  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.545743 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 231 aa  52.8  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  32.43 
 
 		 227 aa  52.4  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 204 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 204 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 217 aa  52.4  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0128  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 235 aa  52  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2629  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 212 aa  52  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 230 aa  52  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 206 aa  52  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2112  transcriptional regulator RutR  36.71 
 
 		 212 aa  52  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2305  transcriptional regulator RutR  36.71 
 
 		 212 aa  52  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 204 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1250  transcriptional regulator RutR  36.71 
 
 		 212 aa  52  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10145  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 280 aa  52  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01016  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.71 
 
 		 212 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 189 aa  51.6  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0087  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 211 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2582  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 212 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0096  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 211 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0589326 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3709  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 221 aa  51.6  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0975739  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1128  transcriptional regulator RutR  36.71 
 
 		 212 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0858  regulatory protein TetR  47.83 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00117784  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1131  transcriptional regulator RutR  37.88 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.33999  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0077  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4147  TetR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>