275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2483 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2483  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 218 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0489732  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1746  TetR family transcriptional regulator  46.73 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227148  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 217 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 258 aa  89.4  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 234 aa  88.6  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1298  transcriptional regulator TetR family  31.49 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 246 aa  72  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3581  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  32.77 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  30.58 
 
 		 241 aa  58.2  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  42.53 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  53.33 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  30.99 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1517  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  55.77 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  39.05 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0708  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 235 aa  54.7  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  33.09 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2889  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00514184  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0590  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 189 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1758  transcriptional regulator of TetR family protein  27.97 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.77056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 233 aa  52.4  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 233 aa  52.4  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0176  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 263 aa  52  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 196 aa  51.6  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0851  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 241 aa  50.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2067  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.580158 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4322  transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 242 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6229  transcriptional regulator TetR family  27.6 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5316  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 226 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  30.61 
 
 		 246 aa  49.3  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 232 aa  49.3  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  25.4 
 
 		 227 aa  49.7  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  22.15 
 
 		 198 aa  48.9  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3284  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 222 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 198 aa  49.3  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 210 aa  49.3  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2195  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 220 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 227 aa  48.9  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 204 aa  48.9  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  52.38 
 
 		 219 aa  49.3  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3995  TetR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 243 aa  49.3  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4783  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 201 aa  48.9  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.690259 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 203 aa  48.9  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2515  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 238 aa  48.9  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.745235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 225 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 199 aa  48.5  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 233 aa  48.5  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000323068 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 232 aa  48.5  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 228 aa  48.5  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  36.96 
 
 		 227 aa  48.1  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  22.82 
 
 		 209 aa  48.1  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3160  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000883166 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2751  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3899  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0449568  normal  0.0930409 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  26.92 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  25.98 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2924  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5749  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>