More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1743 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 244 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  93.85 
 
 		 244 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  93.1 
 
 		 232 aa  431  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4330  TetR family transcriptional regulator  61.78 
 
 		 235 aa  293  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 245 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1718  TetR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 228 aa  164  9e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.114077  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0162  transcription regulator protein  46.05 
 
 		 233 aa  152  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 230 aa  152  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1778  TetR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677686  unclonable  0.000000000627047 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4891  transcriptional regulator, TetR family  41.29 
 
 		 261 aa  149  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164408  normal  0.287477 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 231 aa  146  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0051  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 250 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0054  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 250 aa  142  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3356  TetR family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224117 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  23.76 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 218 aa  67  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  21.62 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 233 aa  62  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 233 aa  62  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.05 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1005  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1189  regulatory protein TetR  25.52 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2751  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.82 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.82 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.82 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.82 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.82 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 199 aa  58.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6709  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.408759  normal  0.497229 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2692  transcriptional regulator, TetR family  25.49 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 206 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5451  transcriptional regulator TetR family  23.66 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1598  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 230 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535122  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 196 aa  57  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6233  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 230 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275362  normal  0.0744328 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02513  transcriptional regulator, TetR family protein  29.49 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  29.23 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2192  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1128  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38.1 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000181094 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5968  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.609129 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2820  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2291  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  36.14 
 
 		 224 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  36.52 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  27.31 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 224 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1426  TetR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 224 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 224 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5724  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4844  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 184 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21800  transcriptional regulator  32 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.391718  normal  0.223847 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 194 aa  54.3  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0371  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1071  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 189 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>