More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1071 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1071  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 240 aa  488  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3897  TetR family transcriptional regulator  65.09 
 
 		 213 aa  278  6e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4794  transcriptional regulator, TetR family  66.83 
 
 		 232 aa  264  8.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1684  TetR family transcriptional regulator  65.05 
 
 		 228 aa  254  8e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.828148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 233 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  35.08 
 
 		 236 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 211 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2213  putative transcription regulator transcription regulator protein  35.15 
 
 		 236 aa  116  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 236 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  25.86 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  27.7 
 
 		 252 aa  72  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 208 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 770 aa  64.7  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 200 aa  62  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 256 aa  62  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  29.77 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  25 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  25.53 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2454  TetR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3517  transcriptional regulator protein  42.86 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873146  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  28.65 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1000  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  26.15 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 202 aa  57  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 192 aa  57  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 212 aa  57  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4955  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5641  regulatory protein, TetR  29.86 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  47.17 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0376  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>