More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5641 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5641  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 205 aa  418  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0939  TetR family transcriptional regulator  64.39 
 
 		 205 aa  278  4e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2192  regulatory protein, TetR  63.41 
 
 		 204 aa  276  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5361  transcriptional regulator, TetR family  61.95 
 
 		 205 aa  273  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296046  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2679  transcriptional regulator, TetR family  64.82 
 
 		 204 aa  271  7e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2481  TetR family transcriptional regulator  61.35 
 
 		 206 aa  267  8.999999999999999e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6577  TetR family transcriptional regulator  62.93 
 
 		 205 aa  266  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  65.98 
 
 		 205 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  65.98 
 
 		 205 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
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NC_010557  BamMC406_6291  TetR family transcriptional regulator  62.93 
 
 		 205 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170422  normal  0.0225355 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  65.98 
 
 		 205 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  64.25 
 
 		 205 aa  265  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5655  TetR family transcriptional regulator  58.05 
 
 		 205 aa  253  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0301112  normal  0.0166104 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46570  putative transcriptional regulator  61.14 
 
 		 205 aa  249  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161907  hitchhiker  0.00000116969 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1558  transcriptional regulator, TetR family  63.37 
 
 		 204 aa  249  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.231141  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2425  TetR family transcriptional regulator  57.07 
 
 		 204 aa  248  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  0.599881 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  60.62 
 
 		 207 aa  248  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3319  transcriptional regulator, TetR family  60.62 
 
 		 205 aa  248  3e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3300  TetR family transcriptional regulator  55.61 
 
 		 204 aa  248  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.161696 
 
 
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NC_003295  RSc3207  putative transcription regulator protein  64.84 
 
 		 204 aa  248  4e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00713158  normal  0.0476395 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3141  TetR family transcriptional regulator  61.83 
 
 		 204 aa  247  9e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1872  TetR family transcriptional regulator  63.89 
 
 		 204 aa  245  4e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_0822  transcriptional regulator, TetR family  59.38 
 
 		 205 aa  241  6e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.752802  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5104  TetR family transcriptional regulator  54.59 
 
 		 205 aa  215  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011365  Gdia_1000  transcriptional regulator, TetR family  48.5 
 
 		 202 aa  196  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011370  Rleg2_6237  transcriptional regulator, TetR family  45.59 
 
 		 204 aa  188  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.250294  normal  0.446462 
 
 
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NC_007778  RPB_4220  TetR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 204 aa  95.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4377  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314155  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  33.92 
 
 		 200 aa  89  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010725  Mpop_1520  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 208 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1358  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 211 aa  88.2  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4072  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 204 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 201 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
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NC_011666  Msil_0096  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 196 aa  84.7  9e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2216  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0817319 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1083  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.243709  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3772  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1522  regulatory protein TetR  31.1 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.485337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1801  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882167  normal  0.119004 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3471  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3759  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4900  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2750  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172363  normal  0.153941 
 
 
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NC_009720  Xaut_2825  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3745  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1755  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0918  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.141078 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1588  transcriptional regulator, TetR family  24.19 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  1 
 
 
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NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1642  regulatory protein TetR  24.12 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.906249  normal  0.298485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1924  transcriptional regulator, TetR family  24.12 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.436993 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124857 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2965  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0278757  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  27.75 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1071  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 240 aa  54.3  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  26.25 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1211  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1344  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000662672 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 233 aa  52.4  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1684  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 228 aa  52.4  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.828148  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 209 aa  52  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 202 aa  51.6  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 223 aa  51.6  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 216 aa  51.6  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 221 aa  51.6  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1177  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0991  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0995  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
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NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  21.31 
 
 		 259 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal  1 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A1237  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_1159  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
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NC_010581  Bind_1464  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  0.959808 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 190 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_0041  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218146 
 
 
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NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
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NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  21.31 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  25.69 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
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