More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3012 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 200 aa  413  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  72.08 
 
 		 199 aa  307  8e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  69.79 
 
 		 203 aa  286  1e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3896  transcriptional regulator, TetR family  65.1 
 
 		 199 aa  265  4e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.971829  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3981  transcriptional regulator, TetR family  64.58 
 
 		 198 aa  262  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000890193 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 196 aa  202  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2291  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 216 aa  86.7  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0176  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  32.21 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5516  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5749  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0851  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5697  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  23.66 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4773  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164473  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5451  transcriptional regulator TetR family  28.41 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4502  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.595773 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1790  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 251 aa  65.1  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4682  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000014918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3995  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 243 aa  64.7  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2244  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2348  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105911 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0468  Transcriptional regulator TetR  30.97 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0116  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 218 aa  62  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  25.18 
 
 		 220 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  28.08 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1517  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 372 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1989  hypothetical protein  48.15 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00163154  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  27.11 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1929  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434465  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1177  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1338  TetR family regulatory protein  27.16 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0841  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1185  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193625  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0653  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0307  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.45423  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1024  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.420909  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1790  transcriptional regulator, TetR family  49.25 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.121253  normal  0.33193 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1587  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2692  transcriptional regulator, TetR family  27.2 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2134  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000323068 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  50.88 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.25 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4062  TetR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4322  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  26.45 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 263 aa  58.2  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0972  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299865  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4761  transcriptional regulator, TetR family  25.3 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3448  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 240 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4645  TetR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 224 aa  57.8  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3899  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 247 aa  57.8  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0449568  normal  0.0930409 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
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NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4995  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal  1 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_1459  TetR family transcriptional regulator  22.88 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540117  normal  1 
 
 
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NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
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NC_007650  BTH_II0891  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007953  Bxe_C0636  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0304513 
 
 
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NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5273  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461714  normal  1 
 
 
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NC_008554  Sfum_1086  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.535417  normal  1 
 
 
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