More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2291 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2291  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 216 aa  448  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3896  transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.971829  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3981  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000890193 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 203 aa  95.9  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 199 aa  93.6  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 196 aa  90.5  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0960  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.462033  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  24.62 
 
 		 243 aa  61.6  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  24.05 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  24.62 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  26.76 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4889  TetR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  23.84 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  22.44 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4844  transcriptional regulator, TetR family  24.77 
 
 		 252 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 245 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0401  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  22.51 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2010  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.267977  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  20 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  32.22 
 
 		 238 aa  52.8  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4396  TetR family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7183  TetR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902217 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 189 aa  52.4  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0462  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 239 aa  52.4  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.573533  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 204 aa  52.4  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2058  transcriptional regulator, TetR family  21.71 
 
 		 213 aa  52  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00904468  normal  0.0313266 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  22.28 
 
 		 214 aa  52.4  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  23.94 
 
 		 232 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 230 aa  52  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  22.08 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 244 aa  52  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4787  transcriptional regulator, TetR family  21.66 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0422575  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1158  transcriptional regulator, TetR family  22.88 
 
 		 218 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91676  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  24.02 
 
 		 224 aa  52  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 232 aa  52  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3257  transcriptional regulator, TetR family protein  35.94 
 
 		 195 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.696599 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1000  regulatory protein, TetR  22.88 
 
 		 242 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2270  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 189 aa  51.6  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4020  TetR family transcriptional regulator  20.63 
 
 		 258 aa  51.6  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4386  TetR family transcriptional regulator  21.66 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4330  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  23.67 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6844  TetR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2751  TetR family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 283 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1739  tetracycline transcriptional regulator YcdC domain-containing protein  21.71 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 239 aa  50.1  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4789  transcriptional regulator  23.12 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06539  hypothetical protein  23.37 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4761  transcriptional regulator, TetR family  21.66 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  22.01 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2924  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 277 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 269 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1683  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  19.63 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  23.47 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 275 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 190 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  20.56 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2510  TetR family transcriptional regulator  21.13 
 
 		 245 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4770  transcriptional regulator, TetR family  21.66 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  23.66 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  19.08 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  22.15 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1517  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 372 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1074  transcriptional regulator, TetR family  21.14 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  hitchhiker  0.00943768 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  19.85 
 
 		 214 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 233 aa  49.3  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000323068 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  19.88 
 
 		 231 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5004  transcriptional regulator, TetR family  21.64 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0270987  normal  0.0251839 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326335 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>