More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_B3257 on replicon NC_011772
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B3257  transcriptional regulator, TetR family protein  100 
 
 
195 aa  390  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.696599 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 
222 aa  63.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  45.9 
 
 
210 aa  62.8  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  45.9 
 
 
210 aa  62.8  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  23.73 
 
 
263 aa  62.4  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 
220 aa  61.2  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
239 aa  60.8  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
218 aa  58.5  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 
238 aa  58.2  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1870  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 
220 aa  57.4  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
205 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
195 aa  55.8  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
191 aa  56.2  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
213 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  34.65 
 
 
195 aa  55.8  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
220 aa  55.1  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 
276 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 
272 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 
272 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
318 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
316 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 
273 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
317 aa  54.3  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3211  regulatory protein, TetR  49.02 
 
 
221 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 
273 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 
273 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
318 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
229 aa  54.3  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 
206 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 
273 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
316 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
318 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
318 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
316 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0392  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 
213 aa  53.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2259  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 
221 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1789  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 
210 aa  53.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.461504  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3483  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
218 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
223 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 
220 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 
186 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1677  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 
288 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.688428  normal  0.314033 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2773  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
295 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00136461  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  38.1 
 
 
204 aa  52.8  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 
215 aa  52.4  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 
204 aa  52.4  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  42.31 
 
 
205 aa  52.8  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  37.93 
 
 
198 aa  52.4  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1684  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
227 aa  52  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3751  putative transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 
178 aa  51.6  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0636766  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2291  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 
216 aa  51.6  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  38.89 
 
 
207 aa  52  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 
194 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  25.2 
 
 
214 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  25.2 
 
 
214 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1938  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
225 aa  51.6  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
234 aa  51.6  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14520  Transcriptional regulator PsrA  42.37 
 
 
239 aa  51.2  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1513  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
189 aa  51.2  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000721449  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5487  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 
205 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3324  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
212 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1699  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
290 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0964215  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 
193 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3508  transcriptional regulator PsrA  40 
 
 
238 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3282  regulatory protein, TetR  40 
 
 
238 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
235 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2410  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 
214 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
200 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
239 aa  50.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 
193 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003766  predicted transcriptional regulator for fatty acid degradation FadQ TetR family  46.94 
 
 
214 aa  49.7  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 
197 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0538  putative transcription regulator protein  49.06 
 
 
340 aa  49.7  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548249  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 
212 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3323  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
227 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 
255 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0794  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 
221 aa  49.3  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
194 aa  49.3  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0069  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 
219 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  41.51 
 
 
213 aa  49.3  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0418  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 
352 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.340149  hitchhiker  0.000146207 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3981  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 
198 aa  48.9  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000890193 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  21.69 
 
 
214 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
235 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
224 aa  48.9  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0433  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 
354 aa  48.9  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.425009  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  38.71 
 
 
233 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  38.71 
 
 
233 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 
213 aa  48.9  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5621  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 
195 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00254336 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
235 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
235 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2766  regulatory protein, TetR  38.89 
 
 
198 aa  48.9  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.597397  hitchhiker  0.0084658 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
235 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 
189 aa  48.5  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
234 aa  48.5  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
235 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3896  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 
199 aa  48.9  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.971829  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
203 aa  48.5  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
211 aa  48.5  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.214617 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>