266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1684 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1684  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 227 aa  465  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4362  TetR family transcriptional regulator  53.42 
 
 		 228 aa  249  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  48.83 
 
 		 228 aa  224  9e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1704  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 285 aa  192  4e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0517004  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3099  TetR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.296713  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0161  TetR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 221 aa  161  9e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4328  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 477 aa  95.1  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0701267  normal  0.0216349 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4438  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 477 aa  95.1  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.829211  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1498  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 183 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.548232  normal  0.295378 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6386  regulatory protein, TetR  28.08 
 
 		 510 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3421  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6831  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1423  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4623  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4168  TetR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 244 aa  68.2  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0511823  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6862  TetR family transcriptional regulator  21.52 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000147849  normal  0.19991 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6843  TetR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.163651  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1666  transcriptional regulator, TetR family  27.2 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2679  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569392  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2766  regulatory protein, TetR  27.44 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.597397  hitchhiker  0.0084658 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 181 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1960  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  32.1 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3257  transcriptional regulator, TetR family protein  31.03 
 
 		 195 aa  52  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.696599 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3324  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 212 aa  52  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1690  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.732657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1753  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 183 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0085  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0016021  decreased coverage  0.0000722764 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4350  TetR family transcriptional regulator  21.76 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1692  transcriptional regulator, TetR family  28.91 
 
 		 192 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.474881 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1586  transcriptional regulator, TetR family  28.91 
 
 		 192 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5031  TetR family transcriptional regulator  21.76 
 
 		 258 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201359  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5829  TetR family transcriptional regulator  21.76 
 
 		 258 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  29.36 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  22.71 
 
 		 245 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 187 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1767  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 192 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0204  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 191 aa  49.7  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0122947  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 245 aa  49.7  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0099  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0469573  hitchhiker  0.000212753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 194 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0308  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 190 aa  48.9  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000556725 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 227 aa  48.9  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1293  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2192  TetR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 225 aa  48.9  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3493  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 222 aa  48.9  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1067  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 202 aa  48.9  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3708  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 217 aa  48.5  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.59565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 220 aa  48.5  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 193 aa  48.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1647  transcriptional regulator, TetR family  25.38 
 
 		 197 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0175  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000233696  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1558  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  20.65 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1070  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  27.59 
 
 		 186 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  25.57 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1856  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 185 aa  47.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  29.11 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  24.03 
 
 		 189 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2060  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0108  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 278 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 193 aa  47  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4065  transcriptional regulator, TetR family  20.35 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 278 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 278 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 283 aa  46.6  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 219 aa  47  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 201 aa  46.2  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8904  putative transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 207 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125651  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  27.59 
 
 		 186 aa  46.2  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 87 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 275 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 193 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 		 199 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  29.77 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 207 aa  45.8  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 192 aa  45.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0102  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 218 aa  46.2  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.478027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>