More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0351 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  457  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  60.45 
 
 		 245 aa  247  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  44.98 
 
 		 231 aa  179  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1778  TetR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677686  unclonable  0.000000000627047 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0162  transcription regulator protein  49.25 
 
 		 233 aa  175  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4891  transcriptional regulator, TetR family  42.79 
 
 		 261 aa  176  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164408  normal  0.287477 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0054  transcriptional regulator, TetR family  46.79 
 
 		 250 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0051  transcriptional regulator, TetR family  46.79 
 
 		 250 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 244 aa  158  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 232 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 244 aa  151  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3356  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 247 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224117 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4330  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 235 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1718  TetR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.114077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 233 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 233 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5551  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 203 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.1306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2751  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 232 aa  72  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  39.78 
 
 		 200 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2064  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  23.71 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  24.02 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  41.77 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0384  transcriptional regulator, TetR family  52.63 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4798  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06539  hypothetical protein  26.55 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1561  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  26.41 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3493  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2710  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1758  transcriptional regulator of TetR family protein  25.45 
 
 		 220 aa  57  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.77056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5635  transcriptional regulator, TetR family  22.7 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0445849  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  21.95 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3229  putative transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.446849 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  39.13 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  39.71 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 277 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  42.17 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3405  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 207 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751749 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2776  TetR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.556184  normal  0.492186 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 194 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 414 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3685  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 203 aa  54.3  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 275 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 272 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3209  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0973  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3200  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415485  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21800  transcriptional regulator  34.25 
 
 		 265 aa  53.9  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.391718  normal  0.223847 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3262  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 192 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2880  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5299  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
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NC_010333  Caul_5380  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768843  normal  0.61228 
 
 
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NC_008146  Mmcs_3662  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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