150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3200 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3200  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  454  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3262  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  454  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3209  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  454  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4630  TetR family transcriptional regulator  61.79 
 
 		 213 aa  252  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0313  TetR family transcriptional regulator  60.95 
 
 		 213 aa  240  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4594  TetR family transcriptional regulator  60.95 
 
 		 211 aa  239  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.780124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5407  transcriptional regulator, TetR family  35.1 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.924589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3563  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 203 aa  106  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3378  regulatory protein TetR  32.26 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0957  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 199 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.962367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0975  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 199 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0353361 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0978  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 199 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4510  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 194 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.576125  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4597  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 194 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.908107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1244  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 206 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4893  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 194 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0909608  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10840  hypothetical protein  32.29 
 
 		 213 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.96162e-38  hitchhiker  0.00000829572 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5109  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 201 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.313188  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4521  hypothetical protein  29.63 
 
 		 244 aa  92.4  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5084  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 193 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3198  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 228 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3260  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3207  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22680  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 202 aa  87.8  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 211 aa  86.3  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0607  putative transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.174677  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4631  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10279  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004651  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1669  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0816  TetR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 221 aa  78.2  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0436  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0331  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0367  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0377  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0356  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0187  regulatory protein TetR  35.04 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1142  transcriptional regulator, TetR family  32.21 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.627372  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4611  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1526  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5042  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  0.617447 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0432  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147068  hitchhiker  0.000000839635 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1283  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0409  FadD27  31.25 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4846  regulatory protein TetR  33.99 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0444  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2442  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5414  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5216  TetR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999138  hitchhiker  0.00983469 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4918  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3570  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649978  decreased coverage  0.00133713 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1840  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0700993  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4696  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3666  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3855  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.898863  normal  0.650046 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0405  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0102  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1073  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1263  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1540  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608661  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2819  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2672  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0121  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2901  TetR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 218 aa  57  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781877  normal  0.0527686 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 305 aa  55.5  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 215 aa  52.4  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 213 aa  52.4  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1682  putative transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 201 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 245 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0353  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0616658  normal  0.0838621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 197 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  35.23 
 
 		 190 aa  49.3  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  43.64 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1897  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0417503  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  21.77 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3166  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.335744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 240 aa  46.2  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2004  regulatory protein TetR  26.73 
 
 		 216 aa  46.2  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.84069  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2888  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 231 aa  46.2  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465905  normal  0.0499957 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 242 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0594  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3329  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 197 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0147538 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 242 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3675  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 222 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 216 aa  45.8  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 201 aa  45.4  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 227 aa  45.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 190 aa  45.1  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1005  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>