88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0356 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_0377  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
205 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0356  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
205 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0367  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
205 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10279  TetR family transcriptional regulator  66.5 
 
 
241 aa  278  5e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004651  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0331  TetR family transcriptional regulator  67.32 
 
 
209 aa  252  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0409  FadD27  64.42 
 
 
165 aa  199  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25545  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4521  hypothetical protein  37.7 
 
 
244 aa  119  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3378  regulatory protein TetR  31.96 
 
 
196 aa  94  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0978  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
199 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1244  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 
206 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0957  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
199 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.962367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0975  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
199 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0353361 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3563  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
203 aa  88.2  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3200  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415485  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3209  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3262  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376016  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5109  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.313188  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5407  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.924589  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5084  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22680  transcriptional regulator  33.54 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3260  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 
245 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3207  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 
245 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3198  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
228 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1526  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
218 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10840  hypothetical protein  31.94 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.96162e-38  hitchhiker  0.00000829572 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0816  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4630  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4893  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0909608  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4597  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.908107 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4510  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.576125  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0607  putative transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.174677  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0436  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
230 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4594  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.780124  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4631  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 
232 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0313  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
213 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1669  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
193 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2901  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 
218 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781877  normal  0.0527686 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0187  regulatory protein TetR  44.19 
 
 
205 aa  59.3  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1283  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
229 aa  58.5  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
202 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
211 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4611  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 
224 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1684  transcriptional regulator, TetR family  36.04 
 
 
202 aa  53.1  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 
202 aa  52.4  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
202 aa  49.3  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1142  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 
236 aa  48.9  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.627372  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 
203 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 
199 aa  48.1  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4918  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 
221 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0444  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 
222 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2656  transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 
212 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0432  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 
222 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147068  hitchhiker  0.000000839635 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1926  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 
202 aa  45.8  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.930045  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0405  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
222 aa  45.4  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 
196 aa  45.4  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 
218 aa  45.1  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
195 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3329  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 
197 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0147538 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2739  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 
225 aa  44.7  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000589766  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1046  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
201 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4846  regulatory protein TetR  29.6 
 
 
228 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1073  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
222 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 
195 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
196 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3166  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 
234 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.335744  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 
195 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2819  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
222 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1540  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
221 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608661  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0102  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
216 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 
220 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
202 aa  42.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3432  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
211 aa  42.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0339823  normal  0.853068 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1263  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
216 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2672  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
217 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0121  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
216 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1283  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 
199 aa  42.7  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1682  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 
201 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  24.03 
 
 
205 aa  42.7  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0397  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 
211 aa  42.4  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0669765  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
202 aa  42.4  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
206 aa  42.4  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1250  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
202 aa  42  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2686  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
202 aa  42  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616794  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 
197 aa  41.6  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  32.63 
 
 
278 aa  41.6  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>