258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0816 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0816  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 221 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0813  hypothetical protein  99.01 
 
 		 101 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 211 aa  125  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5042  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  0.617447 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0102  TetR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1263  TetR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2672  TetR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0121  TetR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1073  TetR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2442  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0444  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1540  TetR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608661  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2819  TetR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0405  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 222 aa  105  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0432  transcriptional regulator, TetR family  31.6 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147068  hitchhiker  0.000000839635 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3570  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649978  decreased coverage  0.00133713 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5414  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4696  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3666  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3855  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 213 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.898863  normal  0.650046 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0187  regulatory protein TetR  28 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 200 aa  89.7  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0957  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.962367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0975  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0353361 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0978  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5407  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.924589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3200  TetR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 224 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3262  TetR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 224 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3209  TetR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 224 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4521  hypothetical protein  30.14 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1142  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.627372  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1244  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3563  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10840  hypothetical protein  27.36 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.96162e-38  hitchhiker  0.00000829572 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3378  regulatory protein TetR  26.37 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3198  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3260  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3207  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4846  regulatory protein TetR  35.53 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0367  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0377  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0356  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5084  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5109  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.313188  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0331  TetR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4510  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.576125  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4597  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.908107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4893  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0909608  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10279  TetR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004651  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0436  transcriptional regulator, TetR family  34.45 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4631  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4918  transcriptional regulator, TetR family  26.73 
 
 		 221 aa  62  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22680  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0607  putative transcriptional regulator, TetR family  21.76 
 
 		 194 aa  61.6  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.174677  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1669  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3166  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.335744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1526  TetR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4611  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1682  putative transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  39.44 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4630  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1283  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 229 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 198 aa  52  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 197 aa  52  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0313  TetR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 213 aa  52  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2901  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 218 aa  52  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781877  normal  0.0527686 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  24.03 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4594  TetR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.780124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 		 248 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 307 aa  49.7  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4794  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 187 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2481  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 206 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 187 aa  48.9  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 209 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 200 aa  48.5  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 242 aa  48.5  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 234 aa  48.5  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 234 aa  48.5  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2058  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 213 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00904468  normal  0.0313266 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1074  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 213 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  hitchhiker  0.00943768 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1842  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 226 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1889  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 226 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1823  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 226 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6398  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237377  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 310 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  25.12 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>