75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1283 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1283  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  434  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3378  regulatory protein TetR  37.96 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0975  TetR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0353361 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0978  TetR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0957  TetR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.962367  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5109  TetR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.313188  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1244  TetR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3260  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3198  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3207  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2901  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781877  normal  0.0527686 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3563  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4631  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0436  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3262  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3200  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415485  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3209  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0444  transcriptional regulator, TetR family  37.39 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4521  hypothetical protein  31.4 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0187  regulatory protein TetR  46.34 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4510  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.576125  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4893  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0909608  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4597  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.908107 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10279  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004651  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0432  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147068  hitchhiker  0.000000839635 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2442  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0331  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5407  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.924589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5084  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3666  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3855  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.898863  normal  0.650046 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4696  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4611  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1682  putative transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 		 201 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0356  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0377  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0367  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 230 aa  53.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0816  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 221 aa  53.1  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5042  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 225 aa  52.4  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  0.617447 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5414  TetR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 218 aa  52  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3570  TetR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649978  decreased coverage  0.00133713 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0405  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2672  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1669  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 193 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0102  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 216 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0121  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 216 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10840  hypothetical protein  34.67 
 
 		 213 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.96162e-38  hitchhiker  0.00000829572 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1073  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 222 aa  48.9  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1263  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 216 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1540  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 221 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608661  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2819  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 222 aa  48.9  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1897  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 200 aa  48.5  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0417503  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1526  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0313  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4594  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.780124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4630  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 213 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0607  putative transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 194 aa  45.4  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.174677  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4846  regulatory protein TetR  32.77 
 
 		 228 aa  45.4  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 213 aa  45.4  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2257  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.36633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3213  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000469892  normal  0.140374 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3202  transcriptional regulator, TetR family  37.38 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  37.5 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22680  transcriptional regulator  38.03 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 194 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4891  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 261 aa  43.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164408  normal  0.287477 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1142  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 236 aa  42.4  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.627372  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1778  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 250 aa  42  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677686  unclonable  0.000000000627047 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3021  regulatory protein, TetR  30.17 
 
 		 205 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2431  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 214 aa  41.6  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0857946 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>