More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0313 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0313  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  426  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4594  TetR family transcriptional regulator  98.1 
 
 		 211 aa  410  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.780124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4630  TetR family transcriptional regulator  91.51 
 
 		 213 aa  366  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3209  TetR family transcriptional regulator  60.95 
 
 		 224 aa  258  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3200  TetR family transcriptional regulator  60.95 
 
 		 224 aa  258  4e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3262  TetR family transcriptional regulator  60.95 
 
 		 224 aa  258  4e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3563  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 203 aa  101  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22680  transcriptional regulator  37.02 
 
 		 202 aa  98.6  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5407  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 211 aa  96.3  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.924589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4893  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 194 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0909608  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4510  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 194 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.576125  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4597  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 194 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.908107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0607  putative transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 194 aa  86.7  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.174677  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5084  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 193 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3378  regulatory protein TetR  36.31 
 
 		 196 aa  85.5  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3198  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 228 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3207  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 245 aa  84.7  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3260  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 245 aa  84.7  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10840  hypothetical protein  30.65 
 
 		 213 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.96162e-38  hitchhiker  0.00000829572 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4521  hypothetical protein  30.65 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5109  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.313188  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1244  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0978  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0957  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.962367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0975  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0353361 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0331  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1669  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4631  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10279  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004651  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0436  transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 		 230 aa  68.2  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0367  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0356  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0377  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1526  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0444  transcriptional regulator, TetR family  36.04 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0816  TetR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1142  transcriptional regulator, TetR family  36.52 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.627372  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4846  regulatory protein TetR  31.34 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4611  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0409  FadD27  28.99 
 
 		 165 aa  62  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1283  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0432  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147068  hitchhiker  0.000000839635 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0102  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1073  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2672  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0187  regulatory protein TetR  33.93 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0121  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2819  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1263  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1540  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608661  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0405  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  29.92 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2442  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5042  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  0.617447 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 305 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1840  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0700993  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 213 aa  52  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3855  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 213 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.898863  normal  0.650046 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4696  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 218 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3666  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 218 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498574  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0162  transcription regulator protein  30.63 
 
 		 233 aa  51.6  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 213 aa  51.6  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  34.15 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3570  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649978  decreased coverage  0.00133713 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0973  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5414  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 309 aa  49.7  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 203 aa  49.7  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5376  putative transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  24.32 
 
 		 196 aa  49.3  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  38.71 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2739  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000589766  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 190 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5390  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 291 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.787919  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>