91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10840 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10840  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  437  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.96162e-38  hitchhiker  0.00000829572 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4597  TetR family transcriptional regulator  75.77 
 
 		 194 aa  313  9e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.908107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4893  TetR family transcriptional regulator  75.77 
 
 		 194 aa  313  9e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0909608  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4510  TetR family transcriptional regulator  75.77 
 
 		 194 aa  313  9e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.576125  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5084  TetR family transcriptional regulator  69.43 
 
 		 193 aa  284  8e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1669  TetR family transcriptional regulator  69.95 
 
 		 193 aa  266  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0607  putative transcriptional regulator, TetR family  44.75 
 
 		 194 aa  153  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.174677  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22680  transcriptional regulator  44.62 
 
 		 202 aa  145  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5407  transcriptional regulator, TetR family  43.37 
 
 		 211 aa  139  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.924589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0978  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0975  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0353361 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0957  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.962367  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3200  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 224 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415485  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3209  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 224 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3262  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 224 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3378  regulatory protein TetR  32.98 
 
 		 196 aa  92.8  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1244  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 206 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4521  hypothetical protein  31.19 
 
 		 244 aa  89.4  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5109  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.313188  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4630  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 213 aa  74.7  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10279  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004651  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4594  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.780124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0816  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0313  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0331  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3260  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0444  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3207  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3198  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0432  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147068  hitchhiker  0.000000839635 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5042  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  0.617447 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0356  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0377  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0367  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5414  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0405  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2442  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4846  regulatory protein TetR  30.67 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3570  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649978  decreased coverage  0.00133713 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3563  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2819  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1073  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0121  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2672  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0102  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1263  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1540  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608661  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3666  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3855  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.898863  normal  0.650046 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4696  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0436  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1526  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4918  transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2901  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781877  normal  0.0527686 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0187  regulatory protein TetR  29.41 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4631  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0409  FadD27  37.36 
 
 		 165 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4611  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 224 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1142  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.627372  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3166  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.335744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3711  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 420 aa  50.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0336995  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 214 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1283  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 229 aa  48.9  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1682  putative transcriptional regulator, TetR family  22.73 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2591  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 305 aa  43.5  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1950  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 240 aa  42.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663338  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2667  TetR family transcriptional regulator  22.82 
 
 		 196 aa  42.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.182644  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 245 aa  42.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  24.44 
 
 		 197 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2970  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 196 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.642297  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2716  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 196 aa  42.4  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0607966  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2644  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 196 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.773011  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2923  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 196 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.30016e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2924  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 196 aa  42.4  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 200 aa  42  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A2934  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 196 aa  42  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_2287  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 218 aa  42  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.101004  normal  1 
 
 
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NC_003909  BCE_2963  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 196 aa  42  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.08395  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 198 aa  41.6  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
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NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 203 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
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