82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3563 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3563  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  400  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3262  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 224 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3209  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 224 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3200  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 224 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415485  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4630  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 213 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3378  regulatory protein TetR  37.62 
 
 		 196 aa  96.7  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0975  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 199 aa  94.7  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0353361 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0978  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 199 aa  94.7  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0957  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 199 aa  94.7  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.962367  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0313  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5109  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.313188  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4594  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.780124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5407  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 211 aa  92.4  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.924589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1244  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4521  hypothetical protein  31 
 
 		 244 aa  89  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0367  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 205 aa  88.2  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0356  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 205 aa  88.2  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0377  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 205 aa  88.2  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22680  transcriptional regulator  34.39 
 
 		 202 aa  86.3  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1526  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 218 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0436  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3207  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 245 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0331  TetR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3260  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 245 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3198  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0816  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10279  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004651  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4631  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 232 aa  74.7  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5084  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1283  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4597  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 194 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.908107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1669  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4510  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 194 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.576125  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4893  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 194 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0909608  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10840  hypothetical protein  29.65 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.96162e-38  hitchhiker  0.00000829572 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0607  putative transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.174677  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1142  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.627372  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0409  FadD27  32.89 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0187  regulatory protein TetR  31.67 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4611  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4918  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0444  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3855  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.898863  normal  0.650046 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3666  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4696  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4846  regulatory protein TetR  29.38 
 
 		 228 aa  54.7  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5042  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 225 aa  51.6  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  0.617447 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0432  transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 		 222 aa  51.6  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147068  hitchhiker  0.000000839635 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2901  TetR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781877  normal  0.0527686 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2442  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  25.86 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1682  putative transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  21.11 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3570  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 219 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649978  decreased coverage  0.00133713 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5414  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5216  TetR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999138  hitchhiker  0.00983469 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 216 aa  45.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 202 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  30.84 
 
 		 197 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 305 aa  45.1  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  24.14 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0405  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1073  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 222 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0121  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0102  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 211 aa  42.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1263  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1540  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 221 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608661  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2819  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 222 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2672  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 217 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 200 aa  42  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  41.6  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 197 aa  41.6  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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