108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3855 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4696  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3666  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3855  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.898863  normal  0.650046 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3570  TetR family transcriptional regulator  95.22 
 
 		 219 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649978  decreased coverage  0.00133713 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2442  TetR family transcriptional regulator  94.26 
 
 		 218 aa  400  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5414  TetR family transcriptional regulator  94.74 
 
 		 218 aa  400  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5042  TetR family transcriptional regulator  91.39 
 
 		 225 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  0.617447 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0405  TetR family transcriptional regulator  71.7 
 
 		 222 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0444  transcriptional regulator, TetR family  71.89 
 
 		 222 aa  299  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1540  TetR family transcriptional regulator  70.75 
 
 		 221 aa  298  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608661  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1073  TetR family transcriptional regulator  70.75 
 
 		 222 aa  298  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2819  TetR family transcriptional regulator  70.75 
 
 		 222 aa  298  4e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0102  TetR family transcriptional regulator  70.75 
 
 		 216 aa  298  5e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1263  TetR family transcriptional regulator  70.75 
 
 		 216 aa  298  5e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0121  TetR family transcriptional regulator  70.75 
 
 		 216 aa  298  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2672  TetR family transcriptional regulator  70.75 
 
 		 217 aa  297  6e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0432  transcriptional regulator, TetR family  70.83 
 
 		 222 aa  288  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147068  hitchhiker  0.000000839635 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0816  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 211 aa  93.2  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 209 aa  90.5  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0957  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.962367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0975  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0353361 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0978  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1244  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1142  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.627372  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22680  transcriptional regulator  29.95 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0187  regulatory protein TetR  34.33 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3378  regulatory protein TetR  38.6 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5109  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.313188  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1682  putative transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5407  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.924589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10840  hypothetical protein  30.37 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.96162e-38  hitchhiker  0.00000829572 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4846  regulatory protein TetR  33.17 
 
 		 228 aa  64.7  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3198  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3260  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5084  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3207  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4521  hypothetical protein  34.95 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3200  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3262  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3209  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4510  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.576125  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4597  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.908107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4893  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0909608  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4631  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1669  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1283  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  26.94 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 233 aa  52.8  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4611  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 224 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3563  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0436  transcriptional regulator, TetR family  38.54 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2156  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.362049 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2901  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781877  normal  0.0527686 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3354  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  27.71 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5172  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.369972  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0607  putative transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.174677  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3233  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.659753 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18610  transcriptional regulator, tetR family  39.29 
 
 		 89 aa  44.3  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.514394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  28.46 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 307 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4918  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 221 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 229 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6448  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264064  hitchhiker  1.59583e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 201 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 195 aa  42.4  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 195 aa  42.4  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 202 aa  42.4  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 208 aa  42.4  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 235 aa  42.4  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  27.63 
 
 		 185 aa  42.4  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 201 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 209 aa  42.4  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 214 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 215 aa  42  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>