109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_22680 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_22680  transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  401  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5407  transcriptional regulator, TetR family  52.91 
 
 		 211 aa  189  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.924589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5084  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 193 aa  165  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4510  TetR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 194 aa  164  8e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.576125  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4597  TetR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 194 aa  164  8e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.908107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4893  TetR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 194 aa  164  8e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0909608  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10840  hypothetical protein  44.62 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.96162e-38  hitchhiker  0.00000829572 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1669  TetR family transcriptional regulator  47.09 
 
 		 193 aa  152  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0607  putative transcriptional regulator, TetR family  42.08 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.174677  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5109  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 201 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.313188  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0978  TetR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 199 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0957  TetR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.962367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0975  TetR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0353361 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1244  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 206 aa  105  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4521  hypothetical protein  33.67 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3378  regulatory protein TetR  35.5 
 
 		 196 aa  102  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4630  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 213 aa  101  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0313  TetR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 213 aa  101  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3200  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 224 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3262  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 224 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3209  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 224 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3260  TetR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 245 aa  98.2  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3207  TetR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 245 aa  98.2  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3198  TetR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 228 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4594  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.780124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0331  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 209 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10279  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 241 aa  92  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004651  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3563  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  89.7  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0367  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 205 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0377  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 205 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0356  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 205 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0436  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 230 aa  89.4  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5414  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 218 aa  84.7  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4696  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 218 aa  84.7  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3666  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 218 aa  84.7  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3855  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.898863  normal  0.650046 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3570  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649978  decreased coverage  0.00133713 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0444  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2442  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5042  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  0.617447 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4611  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 224 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4631  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 232 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0816  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 221 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4846  regulatory protein TetR  32.07 
 
 		 228 aa  74.7  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0405  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0432  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147068  hitchhiker  0.000000839635 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0102  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1073  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1263  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1540  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608661  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2819  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2672  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0121  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 211 aa  72  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0187  regulatory protein TetR  31.25 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0409  FadD27  31.13 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2901  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781877  normal  0.0527686 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1526  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1142  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.627372  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4918  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1682  putative transcriptional regulator, TetR family  23.04 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1283  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 229 aa  52.4  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2069  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 198 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1840  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 213 aa  51.6  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0700993  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 305 aa  50.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3067  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0136  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30147  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2657  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.613192  normal  0.699424 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  27.2 
 
 		 249 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3791  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353737  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0397  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 211 aa  45.4  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0669765  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 232 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 254 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2355  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 204 aa  45.8  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 196 aa  45.4  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0686  transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 		 247 aa  45.1  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 198 aa  45.1  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1671  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.290262  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  28.21 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3354  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1468  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3073  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 248 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1421  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 218 aa  42.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1262  hypothetical protein  41.38 
 
 		 233 aa  42.4  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.683399  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5054  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.817621 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 225 aa  42  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2339  TetR family transcriptional regulator  22.48 
 
 		 208 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249237 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  28.99 
 
 		 205 aa  42  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  30.58 
 
 		 197 aa  42  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 212 aa  41.6  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 236 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>