114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0432 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0432  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 222 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147068  hitchhiker  0.000000839635 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0444  transcriptional regulator, TetR family  92.79 
 
 		 222 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0405  TetR family transcriptional regulator  75.45 
 
 		 222 aa  321  7e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1073  TetR family transcriptional regulator  74.11 
 
 		 222 aa  320  8e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1540  TetR family transcriptional regulator  74.11 
 
 		 221 aa  320  8e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608661  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2819  TetR family transcriptional regulator  74.11 
 
 		 222 aa  320  8e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0102  TetR family transcriptional regulator  74.11 
 
 		 216 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1263  TetR family transcriptional regulator  74.11 
 
 		 216 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2672  TetR family transcriptional regulator  74.11 
 
 		 217 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0121  TetR family transcriptional regulator  74.11 
 
 		 216 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5042  TetR family transcriptional regulator  70.14 
 
 		 225 aa  297  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  0.617447 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4696  TetR family transcriptional regulator  70.83 
 
 		 218 aa  289  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3666  TetR family transcriptional regulator  70.83 
 
 		 218 aa  289  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3855  TetR family transcriptional regulator  70.83 
 
 		 213 aa  288  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.898863  normal  0.650046 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3570  TetR family transcriptional regulator  68.66 
 
 		 219 aa  286  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649978  decreased coverage  0.00133713 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5414  TetR family transcriptional regulator  68.2 
 
 		 218 aa  285  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2442  TetR family transcriptional regulator  68.66 
 
 		 218 aa  284  9e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0816  TetR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 209 aa  99.4  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1142  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.627372  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3378  regulatory protein TetR  37.72 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5407  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.924589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1682  putative transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 201 aa  72  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0957  TetR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.962367  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3198  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0975  TetR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0353361 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3260  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0978  TetR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3207  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4510  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.576125  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4597  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.908107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4893  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0909608  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10840  hypothetical protein  28.85 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.96162e-38  hitchhiker  0.00000829572 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5109  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.313188  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5084  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1244  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3200  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3262  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3209  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4846  regulatory protein TetR  32.28 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1669  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 193 aa  62  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22680  transcriptional regulator  31.34 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0187  regulatory protein TetR  30.65 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4521  hypothetical protein  39.73 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1283  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0436  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 230 aa  53.1  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 212 aa  52.4  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0607  putative transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 194 aa  52.4  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.174677  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4631  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0331  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4611  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 238 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 205 aa  48.9  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 211 aa  48.9  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  23.16 
 
 		 216 aa  48.1  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2901  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781877  normal  0.0527686 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3563  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  28.68 
 
 		 229 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0313  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4594  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.780124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2516  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 188 aa  46.2  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0367  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 205 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0377  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 205 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0356  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 205 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 203 aa  45.8  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0584  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 207 aa  45.1  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4630  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 248 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3153  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 243 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12439 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  26.17 
 
 		 196 aa  42.7  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  26.17 
 
 		 192 aa  42.7  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  27.12 
 
 		 211 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 209 aa  42.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  26.17 
 
 		 196 aa  42.7  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  26.17 
 
 		 196 aa  43.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 196 aa  42.7  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  26.17 
 
 		 192 aa  42.7  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  26.17 
 
 		 196 aa  43.1  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  26.17 
 
 		 195 aa  43.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  26.17 
 
 		 196 aa  42.7  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  24.02 
 
 		 198 aa  43.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1840  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0700993  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4918  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 221 aa  43.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 197 aa  42.4  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 226 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 197 aa  42.4  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  27 
 
 		 198 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>