218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3260 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_3260  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 245 aa  495  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3207  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 245 aa  495  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3198  TetR family transcriptional regulator  99.56 
 
 		 228 aa  454  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4631  TetR family transcriptional regulator  76.65 
 
 		 232 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4611  TetR family transcriptional regulator  74.77 
 
 		 224 aa  315  6e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5407  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 211 aa  99.8  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.924589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3200  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 224 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3262  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 224 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3209  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 224 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22680  transcriptional regulator  34.87 
 
 		 202 aa  87  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0957  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 199 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.962367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0975  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 199 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0353361 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0978  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 199 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3378  regulatory protein TetR  32.83 
 
 		 196 aa  85.5  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1244  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 206 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5109  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.313188  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4521  hypothetical protein  29.59 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3563  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4510  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.576125  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4597  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.908107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4893  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0909608  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5084  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4630  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1526  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0187  regulatory protein TetR  30.26 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0816  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10840  hypothetical protein  26.19 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.96162e-38  hitchhiker  0.00000829572 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0432  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147068  hitchhiker  0.000000839635 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0313  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1283  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4594  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.780124  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0607  putative transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.174677  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0444  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2442  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0367  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0377  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0356  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1669  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 193 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0331  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0405  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0436  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 230 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5042  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  0.617447 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5414  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3855  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.898863  normal  0.650046 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4696  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3666  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3570  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649978  decreased coverage  0.00133713 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2901  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781877  normal  0.0527686 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10279  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004651  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1142  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.627372  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0102  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1073  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1263  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1540  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608661  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2819  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0121  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2672  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 211 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4846  regulatory protein TetR  26.34 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0409  FadD27  28.32 
 
 		 165 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 248 aa  53.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0320  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3166  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.335744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0026  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 194 aa  51.6  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.348467  normal  0.209562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 194 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5216  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999138  hitchhiker  0.00983469 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 194 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 305 aa  50.1  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 206 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1840  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0700993  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 222 aa  49.3  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  35.48 
 
 		 205 aa  49.3  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 203 aa  48.5  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1709  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.400859  normal  0.0301663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 206 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3354  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  26.73 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5615  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328639  normal  0.169387 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  27.43 
 
 		 237 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 224 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 224 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 		 222 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 232 aa  47  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 210 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 209 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 208 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1682  putative transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 201 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.546444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>