74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0607 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0607  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 194 aa  388  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.174677  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4893  TetR family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 194 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0909608  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4510  TetR family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 194 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.576125  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4597  TetR family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 194 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.908107 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10840  hypothetical protein  44.75 
 
 		 213 aa  153  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.96162e-38  hitchhiker  0.00000829572 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5084  TetR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 193 aa  149  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1669  TetR family transcriptional regulator  45.3 
 
 		 193 aa  135  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22680  transcriptional regulator  42.08 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5407  transcriptional regulator, TetR family  41.36 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.924589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3209  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3200  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3262  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4630  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0313  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4594  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.780124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4521  hypothetical protein  29.57 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3260  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3207  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3198  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0377  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0367  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0356  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1244  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0436  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0957  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.962367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0975  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0353361 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0978  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3378  regulatory protein TetR  27.42 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3563  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0187  regulatory protein TetR  29.79 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0816  TetR family transcriptional regulator  21.76 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5109  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.313188  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4631  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4846  regulatory protein TetR  28.22 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10279  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004651  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0331  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1682  putative transcriptional regulator, TetR family  24.18 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0444  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0405  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1526  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 218 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1897  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0417503  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0432  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 222 aa  52.4  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147068  hitchhiker  0.000000839635 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5042  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  0.617447 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1540  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 221 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608661  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1073  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 222 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1263  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2819  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 222 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4611  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0102  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2672  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 217 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0121  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5414  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3570  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 219 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649978  decreased coverage  0.00133713 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0409  FadD27  28.92 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  24.44 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1142  transcriptional regulator, TetR family  25.61 
 
 		 236 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.627372  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3855  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.898863  normal  0.650046 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3666  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4696  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 249 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1283  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 229 aa  45.4  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2442  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 218 aa  45.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5605  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 217 aa  42.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  25.69 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3641  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 197 aa  42.4  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4816  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 244 aa  42  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0244477 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2823  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 208 aa  41.6  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00548665  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  41.6  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1468  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 186 aa  41.2  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781673  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>